而得知曹变蛟前往云南之后，吴三桂加强了川南的进攻，很多地方都是旦夕而下。豫南只剩下巴州等数城。豫东因为有秦良玉在，算是能稳住形势。
四川的本土势力，或向明，或向吴，或自立封王，交战不止。一直以来安稳的天府之国也变的不安稳起来。
淮南。
在闯军兵围武昌的时候，孙可望率八万隆武军渡江南下，与明军连番大战。甚至一度攻下芜湖，杀入宁国府境内。
徽州总兵范云龙起兵响应，南方各地盗贼也纷纷接受隆武朝授予的官职，在各处作乱，南明顿时陷入危机之中。
好在郑鸿逵、张名振及时率水师西进，助黄得功守住当涂。而袁枢、杨廷麟也率江西军北攻安庆，以作牵制。
而马士英、朱大典、、牟文绶、刘肇基等将也纷纷出兵，平定叛乱，使南边局势得以稳定下来。但仍有一支隆武军潜入宁国府，占据以泾县为中心的群山，继续作乱。
明军水军和孙可望多次交战，各有胜负，但始终无法将之赶回巢湖。
南面战乱不止，北边也不安歇。
在东边，多尔衮以唐通、白广恩为将，猛攻沧州、南皮，意图将周显军赶到运河之南。
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