这两台粒子发生器可以以“正正运转”和“正负运转”两种方式进行运作。
在进行“正正运转”时，相同属性的粒子会在舰身两侧形成大量互相对抗的高能粒子流，这些粒子流可以被舰身中部的杆状舱室中装配的粒子弹射器弹射出去，被弹射出去的高能粒子会以光速前进并击穿一切挡在它们面前的东西。
而在进行“正负运转”时，属性相异的粒子会互相融合并稳固下来，它们会将战舰的舰体包裹住，并且阻挡排斥一切试图穿过它们侵入舰体所在范围内的东西。
在被稳固的正负粒子流包裹的期间，任何东西都别想穿过粒子流的保护接近舰体，同时除非粒子发生器被破坏，否则这些粒子流将一直重复生成，几乎不可能被破坏。
有了这一层防护再加上荣耀战舰本身也有灵能护盾系统保护，这就使得它成了一艘几乎无法被击破的太空堡垒。
而且荣耀战舰除了常规的粒子发射器之外也拥有一门主炮，不过这门主炮必须要两台粒子发生器同时超频运作才能启动。
它会汇聚所有不稳定的对抗粒子流一次性朝目标扔过去，其威力相当恐怖，几乎两倍于人类战列巡航舰的大和炮。
但使用这门主炮也会导致荣耀战舰上的两台粒子发生器过载下线，必须要冷却一段时间后才能重新运转。
在粒子发生器的冷却期内，荣耀战舰是非常脆弱的，它既无法启动粒子防御也无法使用粒子弹射器自卫，几乎处于完全的无武装状态。
而除了这个缺点之外，荣耀战舰也还有其他弱点。
最显著的弱点就是荣耀战舰无法同时使用粒子防御与粒子弹射器，它就像一个只有一只手的战士一样，要么举盾，要么举剑，二者不可兼得。
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